自定义质量指标阈值
根据实验室程序或EuroGentest、CAP等指南,为60多个质量指标定义阈值,并保存为SOP以便重复使用。根据阈值将质量样品标记为“合格”,“警告”或“失败”,可确保每次运行的重现性。
临床 NGS 数据质控管理系统
OmnomicsQ 将数据质量控制覆盖到 NGS 分析的每个流程,集中展示数据的精确性、灵敏性和可复现性,帮助诊断实验室持续监测 FASTQ、BAM、VCF 等关键阶段的数据质量。
OmnomicsQ NGS数据质控管理系统由Euformatics开发,其宗旨为临床和检测机构提供高标准的NGS数据质量控制和基因信息深度解读系统,系统具备完备的前端访问界面和后端数据库。
毅硕科技(INSVAST)作为Euformatics在中国区的独家授权机构,我们将始终本着真诚的态度和专业的精神,服务好本地区用户,将Euformatics最新的技术带给中国的精准医疗领域。结合二级分析软件Sentieon、突变数据解读软件Alamut、遗传数据库HGMD Pro,为国内用户提供全流程NGS分析软件解决方案。
omnomicsQ NGS数据质控管理系统,通过自动化、集中化、场景化的解决方案,将NGS分析的每个阶段的数据质量进行集中管理和监测,为诊断实验室和数据质量管理人员提供全面洞悉数据质量的平台。
系统可帮助实验室安全、规范地处理患者相关数据,并对多个参数进行纵向和影响趋势进行分析比对。多样本数据质量控制数据进行统一管理和呈现,方便根据历史数据、室间数据进行基准测试。
根据实验室程序或EuroGentest、CAP等指南,为60多个质量指标定义阈值,并保存为SOP以便重复使用。根据阈值将质量样品标记为“合格”,“警告”或“失败”,可确保每次运行的重现性。
将原本分散在Excel或人工表格中的质控数据集中到omnomicsQ中管理,减少重复性整理工作,提高质控分析效率,并让实验室质量状态更加清晰可见。
支持GUI、Linux命令行、API、Torrent Suite插件及BaseSpace应用等多种使用方式。无论实验室使用商业化流程还是自建分析流程,omnomicsQ均可灵活集成。
对于每台测序仪、每个试剂盒、每个样本,可随时间记录并展示多个质量指标,您可以同时访问这些指标。快速识别被标记为失败和警告的样本,并进一步分析潜在质量问题。
通过持续收集随时间变化的数据,可用多种图表形式展示实验室质控趋势,帮助实验室持续了解测序仪、试剂盒、流程和样本质量的变化。
omnomicsQ 作为覆盖临床NGS分析工作全流程数据质控管理系统,以fastq、bam、vcf、bed等文件为对象,具有以下主要特点: