-
Sentieon软件应用之临床实践
Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。自2015年的初始版本开始，Sentieon推出了包括比对到变异检测在内的完整二次分析的解决方案，可用于胚系突变检测和体细胞突变检测。
多年来，Sentieon软件被业内的制药企业，科研院所，临床医学，农业基因组等领域的用户广泛采用。为了让更多用户了解Sentieon在自己工作的领域的应用案例，CAX-CLOUD从已发表的项目中精选一些有代表性文章作为案例分享给大家。
本文通过分享5篇已发表文章来介绍Sentieon在临床实践中发挥的作用。 -
Sentieon软件应用之肿瘤基因组
Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率，准确度，和可靠性。自2015年的初始版本开始，Sentieon推出了包括比对到变异检测在内的完整二次分析的解决方案，可用于肿瘤与遗传病突变检测。
多年来，Sentieon软件被业内的制药企业、科研院所、临床医学、农业基因组等领域的用户广泛采用。为了让更多用户了解Sentieon在自己工作的领域的应用案例，CAX-CLOUD从已发表的项目中精选一些有代表性文章作为案例分享给大家。 -
Sentieon软件应用之农业基因组
Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。自2015年的初始版本开始，Sentieon推出了包括比对到变异检测在内的完整二次分析的解决方案，可用于胚系突变检测和体细胞突变检测。
Sentieon在全球上百家科研机构以及农业育种公司中被广泛应用，从我们和用户的沟通中了解到，动植物的基因组往往在体积和复杂度方面远大于人类基因组，造成的二级分析时候计算通量的短缺。换用Sentieon软件之后，不但缓解了计算时间的瓶颈，由于Sentieon超越开源软件的稳定性和内存利用效率，在处理多倍型等大型基因组时还可以有效避免流程崩溃等问题。
-
Sentieon软件应用之公共卫生机构
Sentieon致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。自2015年的初始版本开始，Sentieon推出了包括比对到变异检测在内的完整二次分析的解决方案，可用于胚系突变检测和体细胞突变检测。
多年来，Sentieon软件被业内的制药企业，科研院所，临床医学，农业基因组等领域的用户广泛采用。为了让更多用户了解Sentieon在自己工作的领域的应用案例，INSVAT从已发表的项目中精选一些有代表性文章作为案例分享给大家。
本期我们介绍FDA采购Sentieon的情况，以及另外4篇近期发表的文章来介绍Sentieon软件在全球范围内的公共卫生机构中的应用情况。 -
Sentieon软件应用之人群基因组项目
MSSNG队列的joint-calling分析离不开DNAstack, Sentieon和MSSNG研究团队的密切合作。Sentieon的CCDG等效流程生成了快速，可重复，并且可扩展的分析结果。Sentieon和DNAstack团队的通力合作，在分析流程搭建中，使用了一系列创新的解决方案来克服分析速度、大文件IO操作等性能瓶颈，大大缩短了处理时间，提高了后续分析的效率。我们将持续优化这个流程，为将来更大规模的人群队列分析打下基础。
-
Sentieon软件应用之药物研发
Sentieon在全球几十家大中小型制药企业中被广泛应用，无论是临床前科研还是临床研究团队均能从Sentieon软件中获益。从我们和用户的沟通中了解到，和科研机构相比，制药企业对于技术的选择有自己的偏好：相对于技术的前沿性，更加关心技术的成熟度，稳定性以及监管机构的态度。具体到Sentieon软件的使用，大多数药企选择我们和GATK/Mutect2结果匹配的版本，倾向于固定在某一个版本号长期使用。
针对药企团队的特殊需求，Sentieon团队积极提供专业技术支持，针对药企使用的版本可进行分支版本补丁升级，在修复bug的同时避免其他改动。另外Sentieon团队和药企临床部门配合，为分析流程的FDA申请提供完善的文档支持。
