Enabling Precision Data for Precision Medicine
Sentieon 软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型，在保证完全匹配GATK/BWA结果的前提下，计算效率提升15倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案，可同时处理10万个WGS样本的Joint Calling，无需中间步骤。大幅提升WGS/WES/Panel/ctDNA/RNA等基因数据分析效率。
试用申请
行业应用
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2021-12-22 Sentieon 202112使用手册.pdf
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2021-05-07 Citations - Sentieon.pdf
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2020-09-08 Sentieon_Manual.pdf
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2020-07-14 Sentieon_QuickStart.pdf
끂797 194.1 KB -
2020-07-14 Sentieon_Arguments.pdf
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2020-07-14 Sentieon_OutputFileds.pdf
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2020-07-14 Sentieon_ReadGroups.pdf
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Sentieon 致力于解决生物信息数据分析中的速度与准确度瓶颈，通过算法的深度优化和企业级的软件工程，大幅度提升NGS数据处理的效率、准确度和可靠性。
Sentieon为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、动植物研究等多个领域的合作伙伴和科研机构提供软件解决方案，共同推动基因技术的发展，实现“成就精准数据，服务精准医疗“的愿景。
毅硕科技（INSVAST）作为Sentieon Inc. 大中华区授权服务机构，我们将始终本着真诚的态度和专业的精神，坚持并维护Sentieon Inc. 愿景，为大中华区客户提供优质的服务。
资料下载
Sentieon为完整的纯软件二次分析解决方案，该方案涵盖了从基因比对到变异检测的全部流程，可同时用于胚系突变检测和体细胞突变检测。全面支持主流二、三代测序平台，包括illumina、MGI、PacBio、Nanopore、Genemind、IonTorrent、Ultima、Element等。
Sentieon软件忠于BWA、GATK、MuTect、MuTect2、STAR、Minimap2金标准的数学模型，在保证结果完全匹配GATK/BWA金标准的前提下，分析效率提升10倍以上。Sentieon为大群组项目提供一站式Joint Calling解决方案，最大可处理10万个WGS样本的Joint Calling，无需中间步骤。为了方便用户自定义BAM流程，Sentieon提供了Python API Engine。提供UMI模块，替代Fgbio/picard，在更高精度的条件下UMI分析速度提升20倍。提供替代STAR的加速模块，为单细胞测序RNA-seq提供加速计算。
Sentieon软件的使用非常灵活。用户可以直接使用完整Pipeline流程，也可以根据需要单独调用相关模块去替换原流程中的模块。Sentieon模块的输入、输出文件严格按照生信行业规范进行操作，用户可轻松上手，大大降低学习难度和学习时间。
主要模块的应用流程
Sentieon软件为从BWA、GATK、MuTect、MuTect2、Picard切换到Sentieon运行环境的用户，提供了完善的无缝的脚本和示例供用户使用，可参考本页面内的资料下载栏目，下载想要文档进行学习参考。同时为用户方便进行在线学习，我们提供了完善的帮助系统：
在基因计算领域，因为GATK是针对x86指令集开发的，使用没有针对ARM专门优化的GATK将比在x86处理器上要缓慢很多，基因行业很难享受到ARM处理器的低成本优势。因此，我们对Sentieon软件的所有模块针对ARM指令集进行了全面的优化和评测，于2019年11月底推出Sentieon Genomics for ARM软件包，全面支持基于ARMv8架构的处理器，包括AWS Graviton、华为鲲鹏920、AMPERE Altra和阿里云的ARM方案。在保证结果和x86处理器一致的前提下，将已经降低了的基因计算的成本再次降低30%或以上。至此，Sentieon全面兼容从云、超算中心、本地服务器的X86和ARM架构计算。
Sentieon全面兼容X86 & ARM
Sentieon 2015年正式推出软件产品以来，多次赢得国际生信大赛的第一名，获得从速度到精度的全方位认可。通过与行业的逐步融合，Sentieon的工具包一直在为生信一线的用户提供高效可靠的数据分析支撑。
Consistency Challenge
(2016/4/25/-4/26)
-Top Overall Performance
-Highest Reproducibility
Truth Challenge
(2016/4/26/-5/26)
-Highest INDEL Precision
-Highest SNP Recall
2016 ICGC-TCGA DREAM Mutation Calling Challenge Winner
2019 Bio-IT World Innovative Practices Awards
2019 Multi-Omics Mislabeling Challenge Winner
Sentieon软件已被1200多家商业公司和科研机构使用，得到广泛认可。到2022年8月为止，Sentieon软件已经运行处理的数据量超过2700PB，样本量达数百万，时长超过4亿7千万核时。截止2022年第三季度，在包括NEJM、Cell、Nature等世界一级影响因子的刊物上被引用次数多达650篇。
相关链接
Sentieon软件为NGS二级分析用户提供完整的全流程分析模块，用户可自由组合或者全部采用Sentieon功能进行变异检测分析：
针对以上Sentieon提供给客户使用的各种模块，同时我们也针对不同样本类型搭建了行业标准分析流程：
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